A Lagoa Pequena é uma parte de uma lagoa costeira importante na costa da Península de Setúbal - a Lagoa de Albufeira. Inclui a lagoa mais pequena, mais interior, e uma extensa área palustre a montante, separada da lagoa por um dique e alimentada pelas ribeiras da Apostiça e da Ferraria. Nesta zona palustre domina o caniçal, alguns choupos e salgueiros e também algumas áreas abertas de água doce. Na zona envolvente é de referir a importante mancha florestal da Apostiça e da Ferraria, assim como o conjunto dunar e costeiro da Lagoa de Albufeira.

Protecção legal
Nacional: ZPE Lagoa Pequena (PTZPE0049; Decreto-Lei nº 384-B/99, de 23 de Setembro; 68 ha coincidentes com a IBA); SIC proposta Fernão Ferro/Lagoa de Albufeira (PTCON0054; Resolução de Conselho de Ministros nº 142/97, de 28 de Agosto; 4.413 ha, inclui toda a IBA).
Internacional: ZPE Lagoa Pequena; candidatura SIC Fernão Ferro/Lagoa Pequena; Sítio Ramsar da Lagoa de Albufeira (7PT006; 1996; 1.995 ha, inclui toda a IBA).

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Industrialização/urbanização (C), Recreio/turismo (B) Outras (C)