Este sítio abrange uma área rica em habitats naturais, dos quais se destacam os que estão associados a condições bioclimáticas e geológicas muito específicas. O núcleo central da Serra de Monchique, com condições microclimáticas particulares, mantém ainda, nos locais onde a degradação do coberto foi menos drástica, bosques formados por diversas espécies arbóreas, arbustivas e herbáceas com estrutura complexa e multi-estratificada, com uma grande riqueza florística que albergam relíquias paleomediterrânicas, boreo-subtropicais, atlânticas e importantes endemismos. Dada a biodiversidade que aqui se encontra, o ecossistema florestal de Monchique foi identificado como um dos hot-spots forests das florestas naturais europeias. Nas encostas e barrancos mesomediterrânicos hiper-húmidos da Serra de Monchique, surgem bosquetes relíquias residuais com carvalho de Monchique e titímalo de Monchique. Também existem áreas amplas deste sítio com plantações de eucaliptos. O sector central e os vales das principais ribeiras são habitados (povoamento linear que ocupa as várzeas fluviais), surgindo aqui algumas bolsas agrícolas, sobretudo de subsistência. Nas encostas mais sombrias existem povoamentos bem desenvolvidos de medronheiro, planta que é aproveitada localmente.

Protecção legal

Nacional: SIC proposta Monchique (PTCON0037; Resolução do Conselho de Ministros nº 142/97, de 28 de Agosto; 76.008 ha totalmente incluídos na IBA).
Internacional: candidatura SIC Monchique.

Abandono/redução da gestão do terreno (U), Florestação (B), Queimadas e incêndios (A), Desflorestação (comercial) (A), Perturbação (B), Gestão Silvícola intensiva (A), Exploração não sustentável (U), Construção de barragens (A).